O destino da cidade do Rio de Janeiro e de Nascimento se cruzam em Tropa de Elite 2, quando suas aobrigações de pai se chocam com as de policial. Mais maduro, estratégico e solitários, o agora Coronel Nascimento faz o bope crescer e coloca o tráfico de drogas de joelho, isto apenas para descobrir que na segurança pública do Rio de Janeiro nada é o que parece.

O sistema se reinventa e descobre como lucrar sem o intermédio do tráfico, em perseguilção ao caminho trilhado pelo sitstema, nascimento vai além dos limites do quartel, revelando as ligações da milícias com o Estado. E o preço por essa descoberta é alto: O inimigo agora é outro.